牙周病的罪魁是细菌，它在牙周病的发生、发展中起了决定性的作用，细菌附着于牙齿或口腔软组织上，形成菌斑，并且不断发展并产生许多毒性因子，引起牙龈红肿、出血和牙周韧带的破坏，并导致支持牙齿的牙槽骨被破坏和吸收，最终导致牙齿的松动和脱落。而且附着的菌斑长时间停留在牙面和牙周上，就会与口腔中残留的食物碎渣和唾液中的矿物质等钙化形成牙结石，牙结石不仅可因粗糙而刺激、压迫牙龈，（医学网搜集整理）更为重要的是在牙结石的表面易于形成菌斑，且不易去除，为细菌提供了一个破坏牙周组织的基地。现代研究还发现细菌在对牙龈等进行侵害的同时，还会产生可溶性产物，从而引起全身的免疫反应，对牙周病的发生、发展都有着不良作用。